An episome , dalam bidang genetik, adalah molekul DNA yang mampu mereplikasi autonomi dalam sitoplasma sel tuan rumah, dan fizikal bersepadu untuk kromosom sel tuan rumah, juga replikasi sebagai molekul tunggal (pada yang kita namakan bersatu).
Oleh itu, episod ini dapat ditafsirkan sebagai bentuk hidup bersama, dan bukan sebagai jenis replika. Sebenarnya, bagi sebilangan pengarang, transposon dan urutan penyisipan dapat dianggap sebagai episom, kerana ia secara efektif dibawa ke kromosom sel inang, walaupun mereka tidak pernah memiliki kewujudan bebas dan autonomi dalam sitoplasma.
Sebaliknya, dalam sel eukariotik, episom lebih merujuk kepada replika virus yang wujud sebagai plasmid pada sel yang dijangkiti daripada virus yang dapat bergabung ke dalam genom sel inang.
Ini bukan satu-satunya contoh di mana perkataan yang sama bermaksud perkara yang berbeza dalam eukariota dan prokariota (sebagai contoh, istilah transformasi). Episom mempunyai sejarah yang kaya dalam perkembangan genetik moden, kerana ia membantu mengungkap fenomena menarik yang berkaitan dengan keturunan.
Episom yang merupakan bakteriofag
Contoh lain dari episom yang paling terkenal adalah faktor kesuburan, atau plasmid F. Kadang-kadang, bergantung pada pembentukan nukleotida bakteria inang (contohnya, E. coli), plasmid bulat bergabung semula dengan laman web homolog yang terdapat pada kromosom. bakteria yang menimbulkan gabungan.
Maksudnya, plasmid dapat meniru dalam jumlah salinan rendah dalam sitoplasma bakteria, atau jika ia disatukan, replikasi secara keseluruhan dalam nombor salinan yang sepadan dengan bakteria tanpa F (umumnya satu).
Dalam keadaan episomnya, F memberi bakteria kemampuan untuk menghasilkan sejumlah besar rekombinan setelah proses konjugasi.
Bakteria F + (iaitu, yang memiliki plasmid F autonomi) yang menjalani penyisipan unsur ini dikatakan Hfr (untuk frekuensi penggabungan tinggi, untuk akronimnya dalam bahasa Inggeris), kerana oleh peristiwa konjugasi, secara teorinya mampu "menyeret" seluruh kromosom bakteria ke dalam bakteria F (iaitu, kekurangan faktor kesuburan, atau plasmid F).
Secara umum, urutan yang memberikan homologi (dan oleh itu, kesamaan dan pelengkap) antara plasmid F dan kromosom bakteria sehingga proses penggabungan spesifik tapak yang menimbulkan penyatuan disahkan, adalah urutan penyisipan.
Episom dalam sel eukariotik
Atas sebab sejarah, istilah episome (di atas + badan) selalu dikaitkan dengan plasmid, yang pada asalnya berasal dari dunia unsur-unsur ekstrakromosom dalam prokariota.
Semasa mencari unsur serupa dalam eukariota, penggunaan yang sama digunakan untuk menunjuk molekul genom virus yang mampu mereplikasi diri dalam jenis sel yang dijangkiti ini dengan sifat yang serupa dengan plasmid pada prokariota.
Maksudnya, dalam sel eukariotik yang dijangkiti virus, kita dapat menemukan dalam beberapa kes bahawa, sebagai sebahagian daripada kitaran replikasi, virus wujud bersama dalam sel sebagai molekul DNA bulat yang serupa dengan replika lain yang dijelaskan dalam, misalnya, bakteria.
Virus yang paling biasa diketahui yang dapat wujud bersama dengan mereplikasi molekul DNA bulat secara autonomi (dari kromosom inang) tergolong dalam keluarga Herpesviridae, Adenoviridae, dan Polyomaviridae.
Namun, tidak satupun dari mereka terintegrasi ke dalam genom inang, itulah sebabnya dapat dianggap bahawa mereka meniru sebagai plasmid dan bahawa mereka tidak memenuhi kualiti intrinsik yang mencirikan suatu episod: mengintegrasikan ke dalam genom inang.
Walaupun penghapusan istilah itu telah diusulkan, mungkin itu hanya akan menambah kekeliruan pada topik yang sudah cukup rumit.
Kesimpulannya
Ringkasnya, kita dapat mengatakan bahawa episod, secara etimologi, adalah unsur genetik replikasi autonomi yang dapat wujud bersama dalam sel sebagai molekul DNA bebas, atau secara fizikal disatukan ke dalam host.
Akan tetapi, dari sudut pandang genetik, episod adalah plasmid atau virus yang dapat menyatu ke dalam genom prokariotik, atau menjadi salah satu jenis plasmid yang dapat dimiliki oleh sel eukariotik.
Menariknya, virus yang dapat memasukkan ke dalam genom inang eukariotik (retrovirus) tidak dianggap sebagai episom.
Rujukan
- Brock, TD 1990. Kemunculan Genetik Bakteria. Akhbar Makmal Cold Spring Harbor. Cold Spring Harbor, MA, Amerika Syarikat.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley, J. Pengantar Analisis Genetik. WH Freeman & Co, Penerbit McMillan. London, United Kingdom.
- Hayes, W. 1971. Genetik Bakteria dan Virus mereka, Edisi Kedua. Penerbitan Ilmiah Blackwell.
- Jacob, F. & Wollman, EL 1958. Episode les, unsur-unsur génétiques ajoutés. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- Levy, JA, Fraenkel-Conrat, H. & Owens, OS 1994. Virologi, Edisi ke-3. Dewan Prentice. Englerwood Cliffs, NJ, Amerika Syarikat.